Alzheimer hastalığı beyinde nöron membranında normalde bulunan app (amiloid prokürsör protein) parçası olan a-beta birikmesiyle oluşur.
app'den a-beta fragmanını ayıran enzimler olan beta ve gama sekretazın genetik faktörlerle hatalı çalışması sonucu amiloidojenik a-betanın (senil plak) oluştuğu sanılmaktadır.
hastalık öncelikle hipokampusu etkiler.ki hipokampus'ta hafızanın merkezi olarak bilinir.
21. kromozomda kalıtılan app, down sendromlu hastalarda fazlaca yapıldığı için 20'li yaşlarda erken demans gelişir.
aksondaki mikrotübüllerin oluşumunda görev yapan tau proteinin birikimide alzheimer'da nörofibriler yumaklar oluşmaktadır. bu yumaklara hirano cisimciği denir.
apo e proteini alzheimer'deki amiloidotik maddenin stabilizasyonu sağlar. bu nedenle apo e4 homozigot kişilerde erken demans oluşur.
alzheimer hastalığında öcelikle asetilkolinerjik noronlar kayba uğrar.